龟山岛海战唯一的一艘幸存西班牙战舰逃回了马尼拉之后，西班牙的菲律宾总督科奎也不禁大吃一惊，生理人的军队真的有这么可怕吗？连西班牙帝国的精锐海军都不是对手？
而两天以后，郭纳爵、袁朴、吴雁鸣等人带着桑切斯提供的俘虏名单和商毅的信，也到达了马尼拉，向科奎拉正式递交了商毅的信件，科奎拉这才真正相信，二支西班牙舰队都是己全军覆没而告终，另外远征舰队的副司令官也带着队伍，向生理人投降了，而台湾也被生理人占领了。
科奎拉对这一结果觉得实在是有些难以理解，因此又向郭纳爵详细询间了生理人的情况。郭纳爵到也没有隐瞒，把自己所见所知的一切事情都向科奎拉做了交待。但听完了郭纳爵的讲说之后，科奎拉不但没有恍然大悟，反而更糊涂了，郭纳爵的牛皮是不是吹得太大了，仅仅只是生理人的一个大置相当于郡守省长的将军，真的有那么厉害吗？不仅拥有大量可比欧州的先进火器，而且还善于使用欧州的战术？但事情己经发生了，只能接受这个事实。
而两支舰队被全歼，近三千名西班牙籍士兵被抓，其中不乏华金、德拉佩纳这样有身份地位的官员，尽管这不是科奎拉的责任，但也给他带来了很大的压力。同时这两次对中国用兵，也极大的消耗了西班牙在菲律宾的兵力，现在整个菲律宾的西班牙籍士兵也不足千人，战船也只有七条。
如果在这个时候，荷兰人趁机来进攻菲律宾，自己还真的不好抵抗啊，而且按郭纳爵的说法，生理人和荷兰人己经结盟了，这到是很有可能的，科奎拉知道，荷兰人一直都希望找到生理人的合作伙伴。难道说是荷兰人帮助生理人打败西班牙舰队的吗？但荷兰人在亚州似乎也没有这个实力。
但不管怎么样，也不能对帝国的俘虏坐视不管，华金可是宰相大人的儿子，徳拉佩纳、桑切斯也都是贵族，最好还是想办法把他们迎救出来，但再出兵是不可能了，只能选择谈判。科奎拉对中国内陆的了解并不多，但从在马尼拉做生意的中国人那里也大致了解到，中国的皇帝对海外的世界并不感兴趣，而对外国人还算是比较宽容。而且在中国有钱基本就能够搞定一切。
在1603年马尼拉华人大屠杀之后，西班牙就曾派人到中国去求见当时的万历皇帝，希望能够进行辩解，继续保持对华的贸易，那知当时中国的皇帝和官员对这一事件根本就一无所知，就是知道了，也根本不在乎马尼拉的生理人死活，就像什么事情都没有发生一样。
基于这些认识和历史的原因，科奎拉对和中国谈判也颇有信心，虽然从郭纳爵那里听到的信息似乎有些不一样。于是科奎拉派菲律宾总督府的参赞坎比亚索，和少尉索林两人为使者，去和生理人谈判，同时还找了一名商人李清立，和一名传教士卡瓦略陪同郭纳爵、袁朴、吴雁鸣等人一起前往中国。
众人一起乘船出发，数日之后，到达了杭州沿海，还没等靠岸，只见一队战船从他们座船的身边驶过，索林眼尖，一下子就认了出来，当头的一艘这不正是远征舰队的旗舰银河战舰号吗？现在成了生理人军队的战船了，看来郭纳爵神父并沒有说谎啊，远征舰队确定是全军覆没了。
银河战舰号的实力索林是十分清楚的，而且看这一队战船几乎全是西班牙式帆船的船型，而不是生理人惯用的克戎船，如果生理人的海军真的都是西班牙帆船，那到是真的不好对付啊。于是索林把自己的想法告诉给坎比亚索，也令坎比亚索吃惊不小，因为他们这次出使中国，另一个目地就是探看一下生理人的虚实，那么现在看来，生理人的实力确实非同小可。
等船只靠岸之后，汤若望、阿科尼亚等一干洋和尚都己经在码头等着迎接他们的到来。不用问，这也是商毅有意这样安排的。卡瓦略也想不到在这里可以遇到这么多的同行，也不禁十分高兴，赶快来打招呼套近乎。希望能从汤若望等人的嘴里套出一点有用的东西来。
几个洋和尚寒喧了一阵之后，汤若望邀请西班牙使者一行住在教堂里，这也正中卡瓦略等人的下怀，因此也都欣然同意。就在这时，索林忽然脸色大变，指着码头一方，道：“卡瓦略神父，那不是我们的人吗？”
卡瓦略、坎比亚索朝他手指的方向看去，只见在码头的一端，约有百余名衣衫褴褛，还带着手链脚镣的因徒，正在从船搬御货物，看样子都是欧州人的模样，而在他们身边，还有十余名手执皮鞭的中国人监督，不时不挥舞着皮鞭，甩得“啪啪”只响。
坎比亚索也大吃了一惊，赶忙向卡瓦略使了一个眼色，卡瓦略会意问汤若望道：“亚当神父，这是怎么会事，是谁让主的信徒在这里受到这样的苦难？”
汤若望看了那边一眼，道：“不，卡瓦略神父，他们并不是受苦，而是在恕罪，为他们犯下的罪行在恕罪。”
卡瓦略道：“他们犯下了什么罪行。”
汤若望道：“侵略別人的国家，残害别人国家的孑民，这难到不是罪行吗？我相信，这是主在惩罚他们。”
卡瓦略当然不服，激动的道：“不，亚当神父，您怎么能够这样说，毎一个西班牙士兵都是主最虔诚的羔羊，是在消灭邪恶低异教徒，使主的光辉照遍东方的土地，这是异教徒在折摩他们。”
汤若望道：“不，卡瓦略神父，我没有错，错的是他们。主的光芒己经照耀在这里，这里并没有异教徒，而他们无视主的尊严，用暴力对待主的信徒，才遭到这样的惩罚。”
原束来到了杭州之后，汤若望对浙江地区的传教情况和气氛非常满意，正好赶杭州的天主教大教堂完工，汤若望也主持了开堂典礼，商毅也带着亚莉桑徳拉和林凤舞亲自到场祝贺，并且还参加了诪告。同时到场的还有二百多名接受洗礼的教徒，不乏商人、乡绅人等。
由其是得知，林凤舞也是天主教徒的时候，汤若望对商毅也不禁做出了新的评估，出于对中国历史和现况的了解，而且又是站在傍观者的角度，汤若望己经十分清楚，商毅现在的地位，其实己经相当于欧州各国的封建诸候，浙江就是商毅的封地国，在这一亩三分地，商毅的话比皇帝还好使，因此尽管商毅并不是天主教徒，但对天主教在中国的发展至关重要，甚至还胜过了当年的徐光启。
于是汤若望一面写信回欧州，像教皇报告情况，一面也作出决定，在一切事务全力支持商毅，以换取商毅对天主教的更大扶植。因此尽管这一次商毅是与西班牙为敌，而且西班牙人也派来了一位传教士卡瓦略，但汤若望仍然决定，还是站在商毅这一边。而且汤若望是德国人，又是属于耶稣会，和马尼拉的天主教会并不属于一个会派，因此汤若望并没有什么心里负担。
两个洋和尚争了半天，坎比亚索和索林其实也明白，什么异教徒、主的羔羊都是浮云，别人把抓住的战俘当苦力在用，自己能说什么，这可是是在别人的一亩三分地。坎比亚索道：“亚当神父，您知道华金伯爵、还有徳拉佩纳伯爵他们现在怎么样了？难到也是在做苦力吗？”
汤若望的脸露出慈祥的笑容，道：“我的孩子，我虽然不认识你所说的那些人，但凡事犯了错误的人，都必须为自己为自己的罪行付出代价的，主是在借凡人的手在惩罚他们。”
坎比亚索和索林的脸色都变得十分难看，坎比亚索又道：“亚当神父，听说您和这里的生理人长官，那么叫商毅的人很熟，是吗？”
汤若望点了点头，道：“我想我和这位商大人还算是有一点交情，也能够说得一点话，请问有什么可以为您效劳的吗？”
坎比亚索道：“能够让我们见一见华金伯爵吗？那怕是只见一面，只说几句话就可以了。”
汤若望想了一想，道：“好，这件事情我会尽力而为的。现在我们先回教堂去，好吗？”
来到了教堂，西班牙的使者们又是一次震惊，沒想到在这里竞然也能看到这样一座纯欧式风格的教堂建筑，在用餐的时候，汤若望又把商毅的情况向西班牙人做了一次详细的介绍，他说的和郭纳爵所说的内容都差不多，只是更详细一些，但配合着西班牙使者的见闻，说服力也明显要大得多。
而坎比亚索和索林越听越心惊，同时也对完成这次出使的任务，不抱以任何的信心了。